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AI技術如何通過醫療記錄來進行再就診率預測

2019-05-22
關鍵詞: AI 電子醫療

  電子健康記錄里存儲了關于醫院患者的有價值信息,但它們通常是分散的、非結構化的,這使得難以使用AI系統來對其進行省時、省力的解析。幸運的是,紐約大學和普林斯頓大學的研究人員開發了一個框架,用于評估臨床記錄(即癥狀描述、診斷原因和放射學結果),并自動打一個風險評分,來表明患者是否會在未來30天內再次入院就診。他們聲稱,相關的代碼和模型參數已經公開在了Github上,其表現已經輕松超過基準線。

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  “準確預測再入院率具有很重要的臨床意義,表現在效率提升和減輕ICU醫生負擔兩個方面,”該論文的作者寫道。 “一項估計認為,再次入院造成的經濟負擔為179億美元,而其中可避免的入院比例為76%。”

  正如研究人員在一篇在Arxiv.org上預發表的論文中所指出的那樣(“ClinicalBERT:臨床醫療記錄建模和再就診預測”),臨床醫療記錄通常使用縮寫和術語,并且一般很冗長,這對AI系統設計提出了不小的挑戰。為了克服它,他們使用了一種自然語言處理方法 - Google的“變換器雙向編碼器表示”,或簡稱BERT - 通過結合全局的、長跨度的信息來捕獲句子中相距較遠單詞之間的相互聯系。

  在預處理步驟中,每條臨床記錄會被表示成從文本中提取的“子單元”或“子詞單元”的集合。從這些單元組成的多個序列中,ClinicalBERT可識別出哪些單元與哪個序列相關聯。它還可以從與序列相對應的變量中學習掌握子單元的位置,并在每個序列的前面插入用于分類任務的特殊單元。

  為了訓練ClinicalBERT,該團隊采集了一些臨床記錄語料庫,并隱藏了15%的輸入單元,來迫使模型預測隱藏的單元以及任何兩個給定的兩個句子是否連續。然后,利用了“多重參數的智能監護重癥監護(MIMIC-III)”,這是一個電子健康記錄數據集,包括了來自38,597名患者58,976次醫院就診的200多萬條記錄,研究人員使用此數據對該系統進行了微調,以適應臨床預測的任務。

  作者報告顯示,通過由30對醫學術語組成的、用于評估醫學術語相似性的測試樣本進行測試,發現,ClinicalBERT達到了很高的相關性評分,表明它的標記成功捕獲了醫學概念術語之間的相似性。他們說,與心臟相關的概念,如心肌梗塞、心房顫動和心肌,靠得很近,腎功能衰竭和腎功能衰竭也很接近。

  在一項單獨的實驗中,該團隊聲稱,在MIMIC-III語料中,從涉及34,560名患者的、且有連續48或72小時的醫療記錄的數據來看,與僅關注出院數據摘要的模型相比,ClinicalBERT顯示在未來30天再入院預測上效果有提升,相對增加了15%的召回。此外,他們表示,隨著入院時間的延長和臨床筆記數量的增加,系統開始在語言建模任務中的表現開始優于原始BERT模型。

  “ClinicalBERT可以幫助提供護理的人員做出明智的決定,并在必要時提前進行干預,”研究人員寫道。 “它的輸出結果…是可以追溯的,可以理解哪些臨床記錄中的信息與當前預測結果相關,(并且它)也很容易推廣到其他任務,如診斷預測、死亡風險評估或住院時間評估等。”


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