《電子技術(shù)應(yīng)用》
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MEMS技術(shù)投入新冠肺炎的戰(zhàn)疫中

2020-06-20
來(lái)源:電子發(fā)燒友
關(guān)鍵詞: MEMS 新冠肺炎

  美國(guó)食品藥物管理局(US Food and Drug Administration; FDA)緊急授權(quán)加州Cepheid公司銷(xiāo)售一種快速篩檢導(dǎo)致新型冠狀肺炎(Covid-19)病毒SARS-CoV-2的新方法。Cepheid由Kurt Petersen、Allen Northrup和其他五個(gè)人于1996年創(chuàng)立,由于商業(yè)化基于微流體芯片的聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)分析設(shè)備,而在MEMS領(lǐng)域頗負(fù)盛名。但這并不是Cepheid第一次迅速響應(yīng)這一類(lèi)細(xì)菌或病毒等生物威脅。在2001年美國(guó)發(fā)生炭疽熱(anthrax)恐怖攻擊之后,Cepheid率先為美國(guó)郵政(U.S. Postal Service)提供了炭疽桿菌快篩能力,至今仍在使用中。

  當(dāng)今所有Covid-19檢測(cè)方案的核心都是實(shí)時(shí)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)分析技術(shù)。簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),實(shí)時(shí)RT-PCR利用熱循環(huán)擴(kuò)增患者拭抹樣本中的DNA,然后透過(guò)熒光光學(xué)檢測(cè)來(lái)搜尋病毒的特定基因組。

  這項(xiàng)測(cè)試首先需要了解病毒的基因組;中國(guó)科學(xué)家于2020年1月10日首次公開(kāi)發(fā)表了SARS-CoV-全基因組測(cè)序的關(guān)鍵工作。在確定了該病毒的基因組后,以德國(guó)為主導(dǎo)的一支研究小組僅花了7天時(shí)間就發(fā)表了用于測(cè)試患者樣本的第一項(xiàng)方案,目前已由世界衛(wèi)生組織(World Health OrganizaTIon;WHO)加以采用。現(xiàn)在還有其他可能更快速也更經(jīng)濟(jì)的病毒檢測(cè)方法也在研究中,例如抗體檢測(cè)或CRISPR-Cas13測(cè)試等。

  傳統(tǒng)的PCR設(shè)備需要數(shù)小時(shí)才能完成熱循環(huán)并取得結(jié)果。此外,由于患者拭抹樣本中潛在的病毒量較低以及擴(kuò)增DNA的固有限制,傳統(tǒng)的PCR方法可能會(huì)導(dǎo)致大量假陰性反應(yīng)。為了對(duì)抗傳染性疾病爆發(fā),必須既快速又準(zhǔn)確地在患者等待的幾分鐘內(nèi)完成篩檢,以防止陽(yáng)性患者被漏檢,而對(duì)于其他人造成不必要的風(fēng)險(xiǎn)。

  MEMS技術(shù)為PCR帶來(lái)了兩項(xiàng)重要優(yōu)點(diǎn):縮減尺寸以及整合微流體。MEMS加熱器和反應(yīng)室的熱質(zhì)量很小,因此可顯著加快熱-冷循環(huán),并在數(shù)分鐘內(nèi)迅速得到結(jié)果。這種用于樣本和試劑處理的微流體整合實(shí)現(xiàn)了大規(guī)模應(yīng)用的新技術(shù),例如數(shù)字PCR (dPCR)。

  數(shù)字PCR方法利用微流體信道將患者的樣本分成多個(gè)微孔數(shù)組或微滴乳狀液(稱(chēng)為液滴數(shù)字PCR或ddPCR)等多個(gè)單獨(dú)的樣本。然后再將這些微量樣本進(jìn)行平行PCR處理,使其聚合后產(chǎn)生樣本中目標(biāo)分子總數(shù)。這種樣本的微觀平行處理顯著提高了檢測(cè)下限,從而提高了測(cè)試結(jié)果的準(zhǔn)確性。

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  用于數(shù)字PCR的微流控室數(shù)組(來(lái)源:CombinaTI)

  近來(lái)在湖北自然科學(xué)基金會(huì)(Hubei Natural Science FoundaTIon)贊助的一項(xiàng)研究()中,證實(shí)了采用基于MEMS和微流體的PCR工具與技術(shù)來(lái)檢測(cè)SARS-CoV-2,比傳統(tǒng)的PCR方法更具優(yōu)勢(shì)。在這項(xiàng)研究中,液滴數(shù)字PCR (ddPCR)和傳統(tǒng)PCR一并用于測(cè)試患者樣本。這項(xiàng)發(fā)表于今年3月6日的初步研究結(jié)果(尚待進(jìn)一步的臨床試驗(yàn)證實(shí))顯示,ddPCR的SARS-CoV-2檢測(cè)閾值比傳統(tǒng)PCR閾值低500倍。這一結(jié)果意味著,在患者樣本中病毒載量可能較低的情況下,ddPCR比傳統(tǒng)PCR更有可能準(zhǔn)確篩檢出陽(yáng)性患者。

  MEMS PCR芯片的開(kāi)發(fā)始于1990年代初。美國(guó)勞倫斯利佛摩國(guó)家實(shí)驗(yàn)室(Lawrence Livermore NaTIonal Laboratory;LLNL)由Allen Northrup領(lǐng)軍的研究小組于1993年發(fā)表了第一個(gè)基于硅的PCR芯片相關(guān)論文,該芯片后來(lái)也在1996年授權(quán)給Ceph??eid。過(guò)去幾十年來(lái),有關(guān)如何使用MEMS材料和方法制造新穎PCR芯片,以及由硅、玻璃甚至塑料基材制成微型整體分析系統(tǒng)(uTAS)的研究一直在持續(xù)進(jìn)行中。

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  由美國(guó)勞倫斯利佛摩國(guó)家實(shí)驗(yàn)室(LLNL)的Northrup等人開(kāi)發(fā)的首款MEMS硅基PCR芯片(右)已授權(quán)給Cepheid;以及Cepheid現(xiàn)有的測(cè)試盒(右)(來(lái)源:Northrup MA, Ching MT, White RM, Watson RT, “DNA amplification in a microfabricated reaction chamber,” Transducers 1993, Yokohama, Japan. pp. 924–926.)

  如今,學(xué)術(shù)研究人員正致力于使用微加工方法來(lái)開(kāi)發(fā)高度整合的低成本系統(tǒng),特別是用于定點(diǎn)照護(hù)(POC)。 最新的研究案例之一是韓國(guó)ETRI和Genesystem連手的研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一種低成本的手持式PCR原型系統(tǒng),該系統(tǒng)具有聚酰亞胺(聚合物)腔室、微加熱器以及整合的CMOS檢測(cè)器,可用于光學(xué)讀取結(jié)果(如下圖)。

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  可攜式PCR原型橫切面圖示意圖(左),包括腔室、加熱模塊和整合型光偵測(cè)器;以及整合測(cè)試盒(右)。(來(lái)源:DS Lee, OR Choi, and YJ Seo, “A Handheld and Battery-Powered Realtime Microfluidic PCR Amplification Device,” Transducers 2019, Berlin, Germany pp. 1063-1065.)

  這場(chǎng)與時(shí)間賽跑的Covid-19戰(zhàn)疫,也激發(fā)了全球科技公司的各種活動(dòng)和合作。晶體數(shù)字PCR先驅(qū)——法國(guó)Stilla Technologies已經(jīng)與中國(guó)公司合作,為鄭州和信陽(yáng)市提供其N(xiāo)aica數(shù)字PCR系統(tǒng),協(xié)助他們更有效檢測(cè)新型冠狀病毒并監(jiān)測(cè)其變異。在美國(guó),加州Bio-Rad于2020年3月19日宣布,相較于使用qPCR的現(xiàn)有測(cè)試方法,其QX200液滴數(shù)字PCR系統(tǒng)在SARS-CoV-2的臨床檢測(cè)上提供了更高的靈敏度和精確度。根據(jù)美國(guó)FDA宣布的「緊急用戶(hù)許可證」(Emergency Use Authorization;EUA),Bio-Rad正與科羅拉多州的Biodesix合作,致力于使基于ddPCR的測(cè)試用于Covid-19檢測(cè)。甚至是以汽車(chē)和智能型手機(jī)MEMS傳感器而在MEMS產(chǎn)業(yè)中廣為人知的博世(Bosch),也將透過(guò)其Vivalytic分析儀與愛(ài)爾蘭公司Randox Laboratories Ltd合作,提供快篩解決方案。

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  博世Vivalytic分析儀和測(cè)試盒解決方案。(來(lái)源:Bosch GmbH)

  此外,韓國(guó)也迅速征召其生物技術(shù)公司進(jìn)行更全面的測(cè)試,這有助于其更能確定Covid-19疫情并實(shí)施有效的控制措施。

  我們衷心希望Cepheid和其他公司所提供的各種快篩測(cè)試都能在這場(chǎng)全球戰(zhàn)疫中發(fā)揮效用。隨著SARS、MERS和現(xiàn)在的Covid-19相繼流行,似乎可以肯定的一件事是,快速PCR檢測(cè)儀是對(duì)抗病毒爆發(fā)的一項(xiàng)重要醫(yī)療工具。全球正持續(xù)進(jìn)行研究和開(kāi)發(fā)以降低成本、提升檢測(cè)結(jié)果的速度以及準(zhǔn)確性,很快地,我們預(yù)計(jì)將會(huì)在每一位醫(yī)生的診療室中看到配備著一臺(tái)利用MEMS技術(shù)增強(qiáng)的PCR設(shè)備。


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