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CUDA加速的DNA-蛋白質匹配及其優化
所屬分類:
技術論文
上傳者:
aet
文檔大小:
527 K
標簽:
DNA-蛋白質匹配
統一計算設備架構
退火算法
所需積分:0分
積分不夠怎么辦?
文檔介紹:
設計實現了一種使用統一計算設備架構(CUDA)加速DNA-蛋白質匹配的方法。詳細介紹了一種基于退火算法的DNA-蛋白質匹配方法和CUDA的特點,從計算的角度對匹配方法進行了分析。基于CUDA設計實現并行化方法,并根據CUDA的線程調度策略對并行方法進行了優化。實驗結果表明,最大可獲得15倍左右的加速比。
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